XCOM 2 er efterfølgeren til XCOM: Enemy Unknown, det prisvindende strategispil fra 2012. Jorden har forandret sig. Tyve år er gået, siden Jordens statsoverhoved tilbød deres ubetingede kapitulation til rumvæsnerne. XCOM, planetens sidste forsvarslinje, er blevet decimeret og smadret. I XCOM 2 hersker rumvæsnerne på jorden og skaber funklende byer, der primært lover menneskeheden en blændende fremtid, men i sandhed kun skjuler en uhyggelig plan og lukker dem ude, der hopper af den nye verdensorden. Kun dem, der lever på verdens rand, har en lav grad af frihed. Og her samles en magt igen for at kæmpe for menneskeheden. Drevet af konstant at flygte og med kun små udsigter til succes, skal de resterende XCOM-styrker finde en måde at antænde en global modstand og slukke den rumvæsne trussel én gang for alle.